Svá úskalí má ale i samotná léčba. Aplikace léků je při onemocnění plic odlišná než u většiny ostatních chorob. Léky používané při léčbě CHOPN je totiž potřeba dostat přímo do plic prostřednictví inhalátorů. Pro oslabené pacienty, jejichž dech je často povrchní a namáhavý, bývá používání inhalátorů obtížné.