O sto let později však vyhořela a byla přebudována tentokrát do stylu raného baroka. Nejzajímavější část najdeme uvnitř. Jsou to dva barokní zvony, větší Štěpán a Marie zhotovené roku 1671 mladoboleslavským mistrem Janem Pricqueyem. Výjimečné jsou proto, že jsou zavěšené srdcem vzhůru.
Zvony se do pohybu uvádějí šlapáním na pedály. Spolehlivé vysvětlení tohoto způsobu zavěšení zvonů neexistuje, pravděpodobně se jednalo o snahu o změnu klasického způsobu zavěšení. Proti klasickému zvonění je tento způsob zvonění mnohem razantnější, protož nedochází k postupnému rozhoupávání zvonu, které je charakteristické tichým zvoněním na začátku a konci. Na zvony se dnes zvoní pouze několikrát v roce při svátečních příležitostech.
Stejný zvonař zhotovil i dva další, dosud však nezachované zvony Václav, který byl v roce 1808 prodám do Chrudimi a Apoleny, jež byl rekvírován za 1. světové války. V roce 1725 byl do východního okna druhého patra zvonice ještě osazen menší zvonek Umíráček, který se vak také stal obětí válečné rekvizice v roce 1916. Letos byla vypsána veřejná sbírka na doplnění chybějícího zvonu Apolena.
Kouřimský Chrám sv. Štěpána v Kouřimi je architektonickou dominantou města. Trojlodní bazilika zbudovaná současně se stavbou města, ve 2. polovině 13. století, ve své architektuře prolíná románský sloh s obdobím rané gotiky.
