Milada Horáková byla v malé pevnosti vězněna a krutě vyslýchána nacisty. Za protinacistický odboj byla nakonec u říšského soudu odsouzena k osmi letům káznice, přičemž jen o vlásek unikla trestu smrti.
Později byla popravena za údajnou velezradu a spiknutí 27. června 1950 během komunistických zinscenovaných politických procesů. Poprava proběhla na dvoře pankrácké věznice a Milada Horáková ji absolvovala s hrdostí a odvahou sobě vlastní. Stala se jedinou ženou popravenou v Československu během politických procesů a také symbolem odporu proti komunistické straně.
V Památníku Terezín si každý rok připomínají nejen její narozeniny, ale také úmrtí.
