Varhany postavil v roce 1839 varhanář Johann Ferdinand Guth z Čisté u Rakovníka. Jedno z jeho prvních děl nebylo od počátku příliš zdařilé, a tak nástroj v roce 1861 přestavěl c. k. dvorní varhanář Josef Gartner z Prahy. To také byla poslední velká investice do tohoto nástroje.
Chudá farnost neměla nikdy dostatek prostředků na opravy, a tak byly závady na varhanách v průběhu 20. století flikovány, jak jen se dalo. Značně opotřebený, červotočem a vlhkostí poškozený nástroj restauroval v letech 2018 až 2020 varhanář – restaurátor Marek Vorlíček z Domažlic.
Na jejich obnovu přispěla i radnice Prahy 5, v roce 2019 to bylo 200 tisíci korun, loni pak 217 tisíci. Přispělo i hlavní město – 340 tisíci.
Barevný a stříbřitý zvuk osmnácti rejstříků dvoumanuálových varhan s 1 003 píšťalami čeká na své posluchače, až se pandemická situace zklidní.
